國家稅務總局***市**區(qū)稅務局：
我單位20**年1月至12月申報增值稅收入為*****元，20**年1月至12月申報企業(yè)所得稅年度銷售收入*****萬元，相差***萬元，經(jīng)過我單位自查，由以下事項產(chǎn)生的：
一、收到個稅手續(xù)費返還形成差異
我單位20**年*月收到稅務機關(guān)返還的個稅手續(xù)費****萬元。
1.增值稅
我單位收到稅務機關(guān)返還的個稅手續(xù)費，按要求適用稅率繳納增值稅，計入增值稅申報表收入****萬元(換算成不含稅)。
2.企業(yè)所得稅
我單位收到稅務機關(guān)返還的個稅手續(xù)費時，計入其他收益科目****萬元，不需要計入營業(yè)收入。
3.差異說明
按照上述說明，形成了增值稅申報表收入和企業(yè)所得稅申報表收入差異****萬元。
備注：該類差異會計處理科目的差異，再比如銷售自己使用過的固定資產(chǎn)、銷售方收到違約金(增值稅按照收入核算)、財政補貼及金融商品轉(zhuǎn)讓業(yè)務，也屬于該類差異。
【補充案例】某資產(chǎn)管理公司作為資產(chǎn)管理人，2020年度共管理8個資管產(chǎn)品項目，收取管理費3000 萬元。根據(jù)增值稅相關(guān)規(guī)定，自2020 年1 月1 日起，資管產(chǎn)品管理人運營資管產(chǎn)品過程中發(fā)生的增值稅應稅行為，按照3%的征收率繳納增值稅。該資產(chǎn)管理公司運營管理的資管產(chǎn)品發(fā)生增值稅應稅行為，增值稅應稅收入3.09億元，開具了發(fā)票，按3%的征收率計算繳納增值稅900 萬元。
由于資產(chǎn)管理公司與資管產(chǎn)品屬于不同的主體，資產(chǎn)管理公司運營管理資管產(chǎn)品實現(xiàn)的收入歸屬于資管產(chǎn)品，不歸屬于資產(chǎn)管理公司;資產(chǎn)管理公司因運營管理資管產(chǎn)品而收取的管理費收入歸屬于資產(chǎn)管理公司，屬于資產(chǎn)管理公司的收入。因此資產(chǎn)管理公司應將2018 年度因運營管理資管產(chǎn)品而取得的3000 萬元管理費收入計入自身收入，不需將其管理的資管產(chǎn)品實現(xiàn)的3.09億收入計入自身收入。
二、收到房租形成差異
我單位對外出租房屋，租賃期2020年7月1日至2024年6月30日，每月租金30萬元(不含增值稅，下同)，于2020年6月預收到2020年7月1日-2022年6月30日兩年房租720萬元，并開具增值稅發(fā)票。(備注：先要簡單描述事情)
1.增值稅
根據(jù)《財政部、國家稅務總局關(guān)于全面推開營業(yè)稅改征增值稅試點的通知》(財稅〔2016〕36號)文件規(guī)定，納稅人發(fā)生應稅行為并收訖銷售款項或者取得索取銷售款項憑據(jù)的當天;先開具發(fā)票的，為開具發(fā)票的當天。納稅人提供租賃服務采取預收款方式的，其納稅義務發(fā)生時間為收到預收款當天。我單位2020年6月確認增值稅收入720萬元。
2.企業(yè)所得稅
根據(jù)《國家稅務總局關(guān)于貫徹落實企業(yè)所得稅法若干稅收問題的通知》(國稅函〔2010〕79號)規(guī)定，如果交易合同或協(xié)議中規(guī)定租賃期限跨年度，且租金提前一次性支付的，應當按照收入與費用配比原則，出租人在租賃期內(nèi)分期均勻計入相關(guān)年度收入。我單位于2020年度確認該項房租收入180萬元(6個月×30萬元/月)。
3.差異說明
按照上述說明，形成了增值稅申報表收入和企業(yè)所得稅申報表收入差異540萬元。
(備注：該類差異納稅義務發(fā)生時間等政策差異，再比如先賣后買提前開票、視同銷售等差異，也屬于該類差異。)
****有限責任公司
20**年*月*日
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一些特定的業(yè)務，在收入的確認上，增值稅和企業(yè)所得稅的處理是不一樣的，會導致兩個稅種收入產(chǎn)生差異。但不可否認的是，這兩個稅種的收入還是有很強的關(guān)聯(lián)性的，所以稅務機關(guān)金三系統(tǒng)的數(shù)據(jù)比對，肯定會比對這兩個數(shù)字。
有些稅務人員一看見比對不一致，就認為企業(yè)一定有少繳稅的問題，強行要求將企業(yè)補繳稅款。而有些財務人員，可能是賬目不清楚，也可能是為了息事寧人，就糊里糊涂補了稅。
這些做法都是不可取的。
正確的做法是：稅務人員可以要求企業(yè)對兩稅收入不一致做出解釋，不要一口認定企業(yè)少繳稅。而企業(yè)財務人員也能根據(jù)賬目記載，將差異問題一一解釋清楚。
上述就是某企業(yè)的解釋文案，寫得清楚條理，值得參考。